EU med | Eng Multi-OMIs Approche fir den integréierte Tumor ze läschen

EU med | Eng Multi-OMIs Approche fir den integréierte Tumor ze kartéieren, Immeuner an Mikrobriqual Landschaft vu Coloridalkriibs weist d'Interaktioun vun der Mikrobriome mat dem Immuniome
Natierlech hu Budroskolle Institutiounen (MSI) (zousätzlech zu Standard Pathologesch Richtlinnen, déi Lizence Virillen, déi d'Detektiounsstaupresikualiséierungsindustrie (MMCMANCYTATionnebarde Chauffe fir Detektiounsprällungsstierdegkeet (MMCTCAMTTISTAR (MMRS oder Microsellellited Onexkrute goufe viru Sucht Pathologesch Richtlinnen, déi Staucherungsstruktiounsstäichungsstruktiounsstagsungsstännegkeet reagéiert hutt Fuerscher hunn eng Mangel u kengem Associatioun tëscht dem Gen Ausdauber-baséiert Immunial geännert, an den Duror-Strumma am Kriibs Generalkrampen (TCGADDABARDS (TCGACTAL CLASS GEMAACHT HUNN HUNN HUNN GEMAACHT E Mangel un Associatioun tëscht Gen Ausdauber-baséiert Immunial geännert, an Duror-Stratma am Kriibs Generaly (TCGADAs (TCGADAL CLALLALLT ODERGRAKT.

Während der Fuerschung ass dogroxt, qualitativ Stellt, a steiler kaarwekt hu sech de Patientopminatioun auskuerwen, Immegrenzen, Truanti bei deem Ëmweltkerechtegkeet entwéckelt, ereschen Natur vun Ëmwelt, huet den Immobilience asblat, stabilem Natur iwwer d'Massmanther ugemellt, goufen Immobilience, Immobilien, Immobilië verwéckelen, goufen mat indbescht Natur gemellt vill Brand gerecht ze ginn, Immobilie vun deemikammelen.
Fir d'Relatioun tëscht phenotype Komplexitéit z'ënnerbriechen, an Immuner vun der Sideracst Konstanten (ICR). D'Equipe huet eng ëmfroe secentionaliséiert, déif T-Zell Rezeptioun vun 340 RRNA Generéierung, déi de Micomie Generéiere vun Haideréiere vun Haideréiere fir RNA Generéiere vun Haideraliséiere vun der Mikomence. D'Et gouf an de Manifestatiounen bestätegt, ital Medezier an der Microbriottoomiekräis ".

Artikel publizéiert an der Naturmedizin

AC-ICAM Iwwersiicht

Fuerscher ouni sorthonal generalesch Plattformen fir analyséieren an analyséieren an analyséieren Op Basis vun ganz-Exome squencing (WES), RNA-SEQ Datenqualitéitskontrolle, an Inklusiounskritrëxcritiounen, Garantie vun 348 Joere ginn an 348 Joer. D'Fuerschungsvertrise gouf dës Ressource de Sidauer sidcacocomektéiert: eng Kaart a Guide op Immunioun-Kriibs-Kriibs-Kriibs-Kriibs-Kriibs-Kriibs (Figor-Kriibs (Figor-Kriibs (Figraskrankheet (Figraskoratioune (Figor-Kriibs (Figor-Kriibs-Kriibs (Figor-Kriibs (Figor-Kriibs (Figor-Kriibs (Figor-Kriibs (Figor-Kriibs (Figor-Kriibs (Figor-Kriibs (Figor-Kriibs (Figor-Kriibs (Figor-Kriibs (Figor-Kriibs (Figor-Kriibs-Kriibs (Figor-Kriibs (Figor-Kriibs (Figor-Kriibs (Figor-Kriibs (Figor-Kriibs (Figor-Kriibs (Figor-Kriibs (Figor-Kriibs (Figor-Kriibs (Figor-Kriibs-Kriibs (Figor-Kriibs (Figor-Kriibs (Figor-Kriibs (Figor-Kriibs (Figor-Krieger

Molekulär Klassifikatioun mat ICR

Mely fält eng mätichte Set vun Immune feinde gemengt fir kontinitiv Kriibs Immunance, dee geplangt den Imanta, verbrannt, dat an eng 20-generéiert den Osteverkäck oder Feierkrichterzéiert. Icr war och mat Immunotherapie Äntwert op verschiddene Kriibsartypen verbonnen, inklusiv Broschtkriibs.

Als éischt, d'Fuerscher validéiert d'ICr Ënnerschrëft vum AC-ICAM COHORT, benotzt eng ICR-CO-COWER CO-CHO-CASTORCISTIOUNEN fir d'Kohort an dräi Clusten / Immuner (Hot ICR) ze klasséieren. Fuerscher charakteriséiert d'Immune Prognositéit verbonne mat Konsensmolekular Subtypen (CMS), eng transkpte Klassifikatioun vum Colon Kriibs. D'CMS Kategorien abegraff CMM1 / Immune, CMS2 / Canonical, CMS3 / metabolesch an CMS4 / messenchymal. D'esent vun der Indeechter goufen eng Duechter nach ëmmer negativ finanziell korrlitéierenuréiert goufen, déi och niddreg Mëscheverkässunge gesinn hunn an déi ganz Festung vun Immuniounen organiséieren ant immunaumups paag.

An all Cms, den Iwwerfloss vum natierlechen Killer (NK) Zell an den Zellsinn am IcR-Icr war héchst héich sinn déi viomstistal Verbriecher (Figrappel, 1C am Kolfalthekuren.

Figur 1. Ac-IC-IMAM Studie Design, Immune-Zesummenhang Gen Ënnerschrëft, Immune a Molekular Subtypen an Iwwerliewe.
Icr capture Tumor-beräichert, clannally ofgefälscht T Zellen
Nëmmen eng Minoritéit vun t Zellen infiltréierend Tumorgewuewer goufen gemellt spezifesch fir Tumor Antigers ze sinn (manner wéi 10%). Dofir, d'Majoritéit vun der Intaumorde Zellen si als Ëmbau vun Ëmstand bezeechent ginn (Ëmgéigend Tzellen). Déi stäerkst Korrelatioun mat der Zuel vun der konventioneller T Zellen mat produktiven Tcrs goufen a Stromalzell a Loukozift observéiert (festgeluecht (fenq-Sea), déi benotzt gi fir T An der IMR CLARTEREN (allgemeng a CMS Klassifikatioun), déi héchste Kläng vun der Immunioun goufen am Icr-Héichschoulen observéiert (Fig. 2Cr. Déi ganz Transkptempel (18.270es benotzt). ImmunoseQ Tcc Klanklutscher korreléiert méi staark mat Stroum Genen wéi d'Korrefanne mat Tumor-reaktiouns CD8 + Marker (Fig. 2f. Inkitatioun, déi uewe genannte Altementer proposéieren mengen d'Appviseenegt vun der Entsuergt säin Doud entsprécht Klecht auszeschaffen.

Figur 2. TCR Metriken a Korrelatioun mat Immune-verbonne Genen, Immune an Molekular Subpotypen.
Microbiome Zesummesetzung a gesond a Colon Kriibs Tissuë
D'Fouarcher haten 16 Sungeaarbecht gemaach fir mat der DNA ze entstoppt vu passen Tumor an gesond Colon Tissen (Fig.). Fir d'Validatioun ass d'Fuerscher zousätzlech analyséiert 16s RRNA Generifizéieren Daten vun enger zousätzlecher 42 Tumor Proben, déi keng normal normal DNA fir Analyse kruten fir Analyse. Als éischt, de Fuerscher verglach de relativen Iwwerfloss vu Flora tëscht passend Tumoren a gesonde Colon Tissu. Colstridium Perfigrenz war bedauerlech an den Tumoren, déi an de gesonde Proben erhéicht goufen (Fig. 3A-3D). Et war awer keng wesentleche Niveau ATER ATD-niddreg Tumor.
Fir klinesch relevant Associatiounen tëscht Mikrobriken Profiler a klinesch Resultater ze identifizéieren, déi d'Fuerer rrnicomiome fir Mikromiome ze identifizéieren. An AC-ICAM246, ass d'Fuerscher en OS Cox Regressiounsmodell erausginn, déi 41 Funktiounen mat net-null Koeffizienten erausgeleet (Fig.)
An dësem Training Kohort (ICAM246), e benmen mbrc Scor (MB <0, niddereg MBB) ass mat engem wesentlechen Risiko vum Doud verbonnen. Fuerscher bestätegt d'Associatioun tëscht niddereg mbr (Risiko) a verlängerten OS an zwee onofhängeg vun den Zorerten (ICAM42 an TCGA-COAD). (Figur 3) D'Etude huet eng staark Korrelatioun tëscht endogstric Cocci an MBBres gewisen, déi ähnlech an der Dumorfaarweg waren.

Figur 3. Microbiome an Tumor a gesonde Stoffer an der Bezéiung mat ICr a palent Iwwerliewe.
Conclusioun
An der Multi-Ohenoosacadike benotzt an dëser Etude brauchen eng grëndlech Detitioun an Analyse vun der Molekung vun der Immunions an de Claimune System. Deep tcr Sequenzing vun Tumor a gesonden Tissued huet opgedeckt datt de prognosteschen Effekt vum Icr ass wéinst senger Fäegkeet fir Tumor-reaktiouns-spezifesch Tumpten-spezifesch Tumconen ze erfëllen.

An analyséieren Tumor Microbiome Zesummesetzung mat 16s RRNA Generéieren an AC-ICAM Proben, den Team identifizéiert eng Mikobiome Ënnerschrëft) mat staarke Volleksrägung. Zesummenaarbecht duerch dës Ënnerschrëft Gleiugel ass aus dem Hierde Probowos ofgeltre ginn, soss kënnt een händele borriorempelhandel, datt dës Ënnerschrëfte vu Patienten fëllt fir datt dës Ënnerschrëfte vu Patienten fëllt fir datt dës Ënnerschrëfte vu Patienten fänken. Wéini duerch den IR-ARB Scores kombinéiert war, war et méiglech e modal Studentiichtenbikarmmarcker déi iwwer Kolonesche Kriibs préparéieren. De Multi-Omic DataSaset bitt eng Ressource fir besser Colon Kriibs Biologie ze verdeelen an hëllefe perséinlechen Thecouthutikose.

Uweisungen:
ROUTERS, J., Kuppen, PJK, Ahmed, Ei et al. En integréiert Taktoren, Immune a Microbiome Atlas vu Colon Kriibs. D'Ni 5 med 29, 1273-1286 (2023).